বাংলাদেশ জামায়াতে ইসলামীর আমির ডা. শফিকুর রহমান শহীদ মীর কাসেম আলীর অবদান স্মরণ করেছেন। ২০১৬ সালের ৩ সেপ্টেম্বর তার ফাঁসি কার্যকরের দিনকে স্মরণ করে তিনি গণমাধ্যমে প্রকাশিত বিবৃতিতে বলেন, মীর কাসেম আলী আজীবন বাংলাদেশকে সুখী, সমৃদ্ধ ও ইসলামী জনকল্যাণমূলক রাষ্ট্র হিসেবে গড়ে তোলার জন্য সংগ্রাম করে গেছেন।
বিবৃতিতে বলা হয়েছে, তিনি বাংলাদেশ ইসলামী ছাত্রশিবিরের প্রতিষ্ঠাতা কেন্দ্রীয় সভাপতি ছিলেন এবং ইসলামী ব্যাংক-বীমা, মসজিদ-মাদ্রাসা ও নানা জনকল্যাণমূলক প্রতিষ্ঠান প্রতিষ্ঠায় অগ্রণী ভূমিকা পালন করেছেন। বিশেষত দরিদ্র জনগোষ্ঠীর কাছে স্বল্পমূল্যে স্বাস্থ্যসেবা পৌঁছে দেওয়ার ক্ষেত্রে তার উদ্যোগ যুগান্তকারী ছিল।
ডা. শফিকুর রহমান আরও উল্লেখ করেন, ইসলামী আন্দোলনের সঙ্গে সংশ্লিষ্টতার কারণে আওয়ামী লীগের সরকার তার বিরুদ্ধে ষড়যন্ত্রমূলক মামলা দায়ের করে মৃত্যুদণ্ড দেয়, যা কোনো প্রমাণের ভিত্তি ছাড়া প্রণীত হয়েছিল। ২০১৬ সালের ৩ সেপ্টেম্বর রাত সাড়ে ১০টায় তার ফাঁসি কার্যকর করা হয়।
জামায়াত আমির বলেন, “দেশে তিনি যে জনকল্যাণমূলক কার্যক্রমের সূচনা করেছিলেন, তা ইনশাআল্লাহ দীর্ঘকাল অব্যাহত থাকবে। মীর কাসেম আলী মানুষের হৃদয়ে চিরকাল বেঁচে থাকবেন। মহান আল্লাহ যেন তার শাহাদাত কবুল করেন এবং জান্নাতের সর্বোচ্চ মাকাম দান করেন।” তিনি সংগঠনের সকল স্তরের জনশক্তি ও দেশবাসীকে তার রেখে যাওয়া কাজগুলো সফলভাবে শেষ করার আহ্বান জানিয়েছেন